MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK2

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017662	AATC	2	8	27	34	50 %	25 %	0 %	25 %	386707610
2	NC_017662	ATT	2	6	92	97	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386707610
3	NC_017662	ATC	2	6	103	108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707610
4	NC_017662	T	8	8	114	121	0 %	100 %	0 %	0 %	386707610
5	NC_017662	TGA	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707610
6	NC_017662	TAT	2	6	184	189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386707610
7	NC_017662	TC	4	8	197	204	0 %	50 %	0 %	50 %	386707610
8	NC_017662	TC	4	8	241	248	0 %	50 %	0 %	50 %	386707610
9	NC_017662	GAT	2	6	251	256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707610
10	NC_017662	GTT	2	6	275	280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707610
11	NC_017662	T	7	7	279	285	0 %	100 %	0 %	0 %	386707610
12	NC_017662	TCT	2	6	287	292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707610
13	NC_017662	ATC	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707610
14	NC_017662	ACC	2	6	320	325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386707610
15	NC_017662	T	6	6	328	333	0 %	100 %	0 %	0 %	386707610
16	NC_017662	A	7	7	343	349	100 %	0 %	0 %	0 %	386707610
17	NC_017662	TTTTC	2	10	372	381	0 %	80 %	0 %	20 %	386707610
18	NC_017662	GCT	2	6	385	390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707610
19	NC_017662	T	8	8	408	415	0 %	100 %	0 %	0 %	386707610
20	NC_017662	TTG	2	6	492	497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707610
21	NC_017662	TCT	2	6	551	556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707610
22	NC_017662	CTTTC	2	10	559	568	0 %	60 %	0 %	40 %	386707610
23	NC_017662	TCT	2	6	660	665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707610
24	NC_017662	T	6	6	680	685	0 %	100 %	0 %	0 %	386707610
25	NC_017662	T	6	6	698	703	0 %	100 %	0 %	0 %	386707610
26	NC_017662	T	6	6	709	714	0 %	100 %	0 %	0 %	386707610
27	NC_017662	TAT	2	6	748	753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386707610
28	NC_017662	TCT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707610
29	NC_017662	AAT	2	6	834	839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386707610
30	NC_017662	CTT	2	6	855	860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707610
31	NC_017662	TAG	2	6	865	870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707610
32	NC_017662	AAT	2	6	877	882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386707610
33	NC_017662	TTC	2	6	911	916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707610
34	NC_017662	T	7	7	988	994	0 %	100 %	0 %	0 %	386707610
35	NC_017662	TGA	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017662	GAA	2	6	1086	1091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017662	A	10	10	1096	1105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017662	GGT	2	6	1120	1125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017662	TGT	2	6	1301	1306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017662	G	6	6	1368	1373	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017662	CCA	2	6	1510	1515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017662	CCA	2	6	1556	1561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017662	G	6	6	1596	1601	0 %	0 %	100 %	0 %	386707611
44	NC_017662	TTC	2	6	1655	1660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386707611
45	NC_017662	CCGCC	2	10	1682	1691	0 %	0 %	20 %	80 %	386707611
46	NC_017662	CGC	2	6	1709	1714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386707611
47	NC_017662	AT	3	6	1759	1764	50 %	50 %	0 %	0 %	386707611
48	NC_017662	CTG	2	6	1780	1785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707611
49	NC_017662	GCC	2	6	1796	1801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386707611
50	NC_017662	T	6	6	1802	1807	0 %	100 %	0 %	0 %	386707611
51	NC_017662	TCA	2	6	2050	2055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707614
52	NC_017662	AT	3	6	2078	2083	50 %	50 %	0 %	0 %	386707614
53	NC_017662	T	6	6	2171	2176	0 %	100 %	0 %	0 %	386707614
54	NC_017662	G	6	6	2223	2228	0 %	0 %	100 %	0 %	386707615
55	NC_017662	GA	3	6	2247	2252	50 %	0 %	50 %	0 %	386707615
56	NC_017662	TGA	3	9	2275	2283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707615
57	NC_017662	AAC	2	6	2316	2321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386707615
58	NC_017662	GCG	2	6	2335	2340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386707615
59	NC_017662	CCG	2	6	2393	2398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386707615
60	NC_017662	GCTG	2	8	2410	2417	0 %	25 %	50 %	25 %	386707615
61	NC_017662	GGT	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386707615
62	NC_017662	GA	4	8	2516	2523	50 %	0 %	50 %	0 %	386707615
63	NC_017662	GTC	2	6	2543	2548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707615
64	NC_017662	GAT	2	6	2567	2572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707615
65	NC_017662	GGT	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386707616
66	NC_017662	GGGA	2	8	2631	2638	25 %	0 %	75 %	0 %	386707616
67	NC_017662	GAA	2	6	2679	2684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707616
68	NC_017662	GAA	2	6	2717	2722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707616
69	NC_017662	GCC	2	6	2762	2767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386707616
70	NC_017662	GGA	2	6	2769	2774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386707616
71	NC_017662	A	7	7	2824	2830	100 %	0 %	0 %	0 %	386707616
72	NC_017662	TAC	2	6	2934	2939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707616
73	NC_017662	TCC	2	6	3040	3045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386707616
74	NC_017662	GAAAC	2	10	3060	3069	60 %	0 %	20 %	20 %	386707616
75	NC_017662	CGG	2	6	3221	3226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386707616
76	NC_017662	ACGG	2	8	3270	3277	25 %	0 %	50 %	25 %	386707616
77	NC_017662	AG	4	8	3303	3310	50 %	0 %	50 %	0 %	386707616
78	NC_017662	ACG	2	6	3335	3340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707616
79	NC_017662	CAG	2	6	3345	3350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707616
80	NC_017662	GGA	2	6	3432	3437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386707616
81	NC_017662	A	6	6	3445	3450	100 %	0 %	0 %	0 %	386707616
82	NC_017662	GAT	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707616
83	NC_017662	GCA	2	6	3480	3485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707616
84	NC_017662	CGG	2	6	3585	3590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386707616
85	NC_017662	GAA	2	6	3610	3615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707616
86	NC_017662	GAA	2	6	3689	3694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707616
87	NC_017662	CAG	2	6	3722	3727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707616
88	NC_017662	AGC	2	6	3818	3823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707616
89	NC_017662	AGA	2	6	3881	3886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386707616
90	NC_017662	CAG	2	6	3946	3951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386707616
91	NC_017662	GAGC	2	8	3963	3970	25 %	0 %	50 %	25 %	386707616
92	NC_017662	AG	3	6	4014	4019	50 %	0 %	50 %	0 %	386707616
93	NC_017662	GGT	2	6	4239	4244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386707620
94	NC_017662	TTG	2	6	4245	4250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707620
95	NC_017662	CTG	2	6	4265	4270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386707620
96	NC_017662	TCA	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707621
97	NC_017662	GT	3	6	4445	4450	0 %	50 %	50 %	0 %	386707621
98	NC_017662	ATT	2	6	4452	4457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386707621
99	NC_017662	T	6	6	4488	4493	0 %	100 %	0 %	0 %	386707621
100	NC_017662	TC	3	6	4706	4711	0 %	50 %	0 %	50 %	386707621
101	NC_017662	TATG	2	8	4715	4722	25 %	50 %	25 %	0 %	386707621
102	NC_017662	CAAG	2	8	4747	4754	50 %	0 %	25 %	25 %	386707621
103	NC_017662	GTT	2	6	4796	4801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707621
104	NC_017662	TATG	2	8	4837	4844	25 %	50 %	25 %	0 %	386707621
105	NC_017662	T	8	8	4869	4876	0 %	100 %	0 %	0 %	386707621
106	NC_017662	A	6	6	4887	4892	100 %	0 %	0 %	0 %	386707621
107	NC_017662	GTTT	2	8	4936	4943	0 %	75 %	25 %	0 %	386707621
108	NC_017662	AAC	2	6	4982	4987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386707621
109	NC_017662	A	6	6	5008	5013	100 %	0 %	0 %	0 %	386707621
110	NC_017662	TTTA	2	8	5135	5142	25 %	75 %	0 %	0 %	386707621
111	NC_017662	CAT	2	6	5185	5190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386707621
112	NC_017662	TC	4	8	5262	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	386707621
113	NC_017662	ATG	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386707621
114	NC_017662	GTT	2	6	5348	5353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386707621

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.